Original scientific paper
https://doi.org/https://doi.org/10.5513/JCEA01/27.3.5114
Molekulárne profilovanie a skríning genetickej variability rastlinných druhov pomocou markera konzervovanej RCAR domény
Aqsa ABBAS
; Institute of Plant and Environmental Sciences, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Slovak University of Agriculture in Nitra, Tr. A. Hlinku 2, 949 76, Nitra, Slovak Republic
Jana ŽIAROVSKÁ
; Institute of Plant and Environmental Sciences, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Slovak University of Agriculture in Nitra, Tr. A. Hlinku 2, 949 76, Nitra, Slovak Republic
Alžbeta JAUSCHOVÁ
; Institute of Plant and Environmental Sciences, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Slovak University of Agriculture in Nitra, Tr. A. Hlinku 2, 949 76, Nitra, Slovak Republic
*
Lenka KUČEROVÁ
; Institute of Plant and Environmental Sciences, Faculty of Agrobiology and Food Resources, Slovak University of Agriculture in Nitra, Tr. A. Hlinku 2, 949 76, Nitra, Slovak Republic
* Corresponding author.
Abstract
RCAR doména (regulačná zložka receptora ABA), konzervovaná oblasť spojená so signalizáciou kyseliny abscisovej (ABA), hrá významnú úlohu v stresových reakciách rastlín a vývinových procesoch. V tejto štúdii bola použitá novo vytvorená technika DNA markerov založená na konzervovanej doméne RCAR na posúdenie genetickej diverzity a vzťahov medzi 25 rastlinnými druhmi vrátane liečivých rastlín, stromov a zeleniny a 20 odrodami rajčiakov (Solanum lycopersicum L.). PCR amplifikácia s použitím degenerovaných primerov úspešne produkovala amplikóny v rozpätí 200 – 500 bp vo všetkých analyzovaných druhoch. Analýza genetickej podobnosti založená na Jaccardových koeficientoch odhalila vysokú homogenitu medzi kultivarmi rajčiakov (> 85 %), zatiaľ čo ostatné rastlinné vykazovali širšiu genetickú variabilitu (30 – 80 %). Klastrovanie UPGMA a AMOVA podporili genetické odlišnosti medzi rajčiakmi a inými rastlinnými druhmi, pričom 72 % variácií bolo vplyvom medzidruhových rozdielov. Tieto výsledky demonštrujú užitočnosť markerov založených na doméne RCAR pri hodnotení medzidruhových a vnútrodruhových genetických vzťahov, čo poskytuje základ pre budúce štúdie funkčných úloh RCAR v adaptácii a signalizácii rastlín.
Keywords
DNA markéry; genetická diverzita; odrody rajčiakov; interšpecifická variabilita
Hrčak ID:
351480
URI
Publication date:
1.10.2026.
Visits: 0 *