Izvorni znanstveni članak
Razvitak mnogostrukoga proširenoga testa za pojedinačne baze pri testiranju haploskupina mitohondrijske DNA
Tahnee M. Nelson
Rebecca S. Just
Odile Loreille
Moses S. Schanfield
Daniele Podini
Sažetak
Cilj Razviti test za brzo pretraživanje, kako bi se skratilo vrijeme testiranja i potrošnja uzorka pri određivanju
haploskupina mitohondrijske DNA.
Postupci U svrhu vrjednovanja testa ukupno je testirano 147 uzoraka, uključujući 73 uzorka kojima je
uspješno određena haploskupina s pomoću tipizacije kontrolnog područja (engl. control region, CR)
mitohondrijske DNA (mtDNA), 21 uzorak s nepotpuno tipiziranom haploskupinom na osnovi CR, i 31 uzorak
poznatog nasljednog izvora kojima prethodno nije tipizirana haploskupina. Dodatno su s pomoću sustava
mnogostruke analize kratkih jezgrenih polimorfnih odsječaka (engl., short nuclear polymorphism, SNP)
analizirane dvije jako degradirane ljudske kosti zakopane krajem četrdeseetih godina prošloga stoljeća.
Rezultati Kad je mnogostruki sustav SNP primijenjen za tipizaciju 96 uzoraka s prethodno sekvencioniranim
CR, opaženo je povećanje definiranja haploskupine ili makrohaploskupine u odnosu na uobičajenu analizu
slijeda CR. Prošireni test za pojedinačne baze uspješno je primijenjen u određivanju haploskupina iz uzoraka
kostiju starih desetljećima, još iz II. Svjetskoga rata.
Zaključak Mnogostruki sustav SNP uspješno je primijenjen za određivanje statusa haploskupina jako
raspadnutih ljudskih kostiju, čime je pokazao sposobnost odstranjenja mogućih onečišćenja. Mnogostruki
sustav SNP predstavlja jeftin a vrlo učinkovit postupak kojim se mogu tipizirati haploskupine mtDNA A, B, C,
D, E, F, G, H, L1/L2, L3, M i N, što znači da se može dobro iskoristiti za brza pretraživanja pri identifikaciji
ljudi ili u antropološkim istraživanjima.
Ključne riječi
kostiju; mitohondrijske DNA (mtDNA); haploskupina
Hrčak ID:
16585
URI
Datum izdavanja:
15.8.2007.
Posjeta: 2.123 *