Acta Adriatica, Vol. 64 No. 2, 2023.
Izvorni znanstveni članak
https://doi.org/10.32582/aa.64.2.3
Intraspecifična karakterizacija izolata Vibrio alginolyticus prikupljenih iz sustava akvakulture i morskih biotopa u Tunisu korištenjem PCR-RFLP, ECP i OMPS profiliranja.
Rim Lajnef
orcid.org/0000-0002-2482-1052
; Laboratoire de Traitement des Eaux Usées, Centre de Recherches et des Technologies des eaux, Technopôle de Borj-Cédria, HammamLif, Tunisia
Lotfi Ben Abdallah
orcid.org/0000-0002-5084-0329
; Institut National des Sciences et Technologies de la Mer, Salammbô, Tunisia
Silvana Tapia-Paniagua
; Departamento de Microbiologia, Facultad de Ciencia de Malaga, Malaga, Spain
Yosra Turki
; Laboratoire de Traitement des Eaux Usées, Centre de Recherches et des Technologies des eaux, Technopôle de Borj-Cédria, HammamLif, Tunisia
Alberto Medina
; Departamento de Microbiologia, Facultad de Ciencia de Malaga, Malaga, Spain
Ines Mehri
; Laboratoire de Traitement des Eaux Usées, Centre de Recherches et des Technologies des eaux, Technopôle de Borj-Cédria, HammamLif, Tunisia
Miguel Angel Moriñigo
; Departamento de Microbiologia, Facultad de Ciencia de Malaga, Malaga, Spain
Abdennaceur Hassen
; Laboratoire de Traitement des Eaux Usées, Centre de Recherches et des Technologies des eaux, Technopôle de Borj-Cédria, HammamLif, Tunisia
Sažetak
Ukupno 54 vjerojatna soja Vibrio alginolyticus izolirana su iz raznih morskih biotopa u Tunisu, iz morske vode i sedimenta s nekoliko kupališta i uzgajališta te su karakterizirani i identificirani pomoću nekoliko biokemijskih testova. Istraživana je prikladnost metoda kao što su analiza polimorfizma duljine restrikcijskih fragmenata PCR proizvoda (PCR-RFLP), profiliranje izvanstaničnih proizvoda (ECP) i proteina vanjske membrane (OMP) kao alata za istraživanje raznolikosti Vibrio alginolyticus unutar ove složene skupine. Rezultati su pokazali da postoji velika heterogenost u raznolikosti određenoj metodom PCR-RFLP koja se odnosila na broj genotipova generiranih s dva testirana enzima SduI i FaqI. Ova heterogenost je uočena ne samo prema podrijetlu (morska voda, sediment, uzgajališta riba i školjkaša), već i unutar istog tipa uzorka. Druge dvije metode, ECP i OMP rezultirale su s 32, odnosno 26 profila. Indeks diskriminacije utvrđen u ovoj studiji istaknuo je dobru sposobnost PCR-RFLP metode u razlikovanju sličnih sojeva V. alginolyticus.
Ključne riječi
Vibrio alginolyticus; izvanstanični produkti (ECP); protein vanjske membrane (OMP); PCR-RFLP; Tunis
Hrčak ID:
307510
URI
Datum izdavanja:
25.8.2023.
Posjeta: 404 *