Izvorni znanstveni članak
Novi bakteriocinogeni sojevi Lactobacillus plantarum i njihova diferencijacija analizom slijeda 16S rDNA, 16S-23S i 23S-5S međugenskih razmaknica, te analizom nasumično umnožene polimorfne DNA
Morteza Shojaei Moghadam
; Department of Bioprocess Technology, Faculty of Biotechnology and Biomolecular Sciences, University Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor Darul Ehsan, Malaysia
Hooi Ling Foo
; Department of Bioprocess Technology, Faculty of Biotechnology and Biomolecular Sciences, University Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor Darul Ehsan, Malaysia
Thean Chor Leow
; Institute of Bioscience, University Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor Darul Ehsan, Malaysia
Raha Abdul Rahim
; Department of Cell and Molecular Biology, Faculty of Biotechnology and Biomolecular Sciences, University Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor Darul Ehsan, Malaysia
Teck Chwen Loh
; Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor Darul Ehsan, Malaysia
Sažetak
Ispitana je prisutnost strukturalnih bakteriocinskih gena u šest sojeva Lactobacillus plantarum (TL1, RG11, RS5, UL4, RG14 i RI11), izoliranih iz malezijske hrane. Nova kombinacija strukturalnih gena za plantaricin EF i plantaricin W uspješno je umnožena iz svih ispitanih sojeva, što upućuje na to da se radi o novim sojevima L. plantarum koji proizvode bakteriocine. Usporednom analizom sa 17 sojeva L. plantarum pohranjenih u GenBank otkrivena je varijabilna regija od četiri para baza u kratkim 16S-23S međugenskim razmaknicama tih sojeva, potvrđujući da se radi o novim genotipovima. Ispitani sojevi L. plantarum nakon toga su razvrstani u četiri skupine, na temelju uočene varijabilne regije od četiri para baza kratke 16S-23S međugenske razmaknice. Daljnjom analizom DNA slijeda 23S-5S međugenske razmaknice otkriven je samo jedan tip te razmaknice, pokazujući da je konzerviran u ispitanim sojevima L. plantarum. Trima pokusima nasumičnog umnožavanja polimorfne DNA, koristeći tri različite kombinacije proizvoljno odabranih početnica, uspješno su diferencirani ispitani sojevi L. plantarum, što potvrđuje da se radi o različitim sojevima. Dakle, može se zaključiti da novi sojevi L. plantarum proizvode bakteriocin i da se mogu uspješno razlikovati analizom nasumično umnožene polimorfne DNA i varijabilne regije kratke 16S-23S međugenske razmaknice.
Ključne riječi
bakteriocinski gen; diferencijacija; Lactobacillus plantarum; ribosomalna međugenska razmaknica
Hrčak ID:
61717
URI
Datum izdavanja:
15.12.2010.
Posjeta: 1.981 *