Short communication, Note
Identifikacija vrsta i kemotipova plijesni roda Fusarium izravnim sekvenciranjem pomoću brze metode lančane reakcije polimerazom, u svrhu praćenja sigurnosti hrane
Marine Pallez
; Public Research Centre Gabriel Lippmann, Environment and Agro-Biotechnologies Department, 41, rue du Brill, LU-4422 Belvaux, Luxembourg
Matias Pasquali
; Public Research Centre Gabriel Lippmann, Environment and Agro-Biotechnologies Department, 41, rue du Brill, LU-4422 Belvaux, Luxembourg
Torsten Bohn
; Public Research Centre Gabriel Lippmann, Environment and Agro-Biotechnologies Department, 41, rue du Brill, LU-4422 Belvaux, Luxembourg
Lucien Hoffmann
; Public Research Centre Gabriel Lippmann, Environment and Agro-Biotechnologies Department, 41, rue du Brill, LU-4422 Belvaux, Luxembourg
Marco Beyer
; Public Research Centre Gabriel Lippmann, Environment and Agro-Biotechnologies Department, 41, rue du Brill, LU-4422 Belvaux, Luxembourg
Abstract
Za razvoj preventivnih mjera koje se provode radi poboljšanja sigurnosti hrane neophodno je odrediti toksičnost plijesni roda Fusarium, pa se sekvenciranjem i genetskom kemotipizacijom pomoću metode lančane reakcije polimerazom određuju vrste ovoga roda plijesni. U radu je predložen brzi protokol za standardni postupak utvrđivanja vrste plijesni sekvenciranjem faktora elongacije 1α i multipleks kemotipizacijom s pomoću gena Tri12. Provedena je i statistička obrada dobivenih podataka. Kao podloga za uzgoj plijesni upotrijebljen je filter papir Miracloth, a DNA je iz plijesni izdvojena pomoću mikrovalova. Ispitano je 75 sojeva plijesni Fusarium culmorum i Fusarium graminearum, te je zaključeno
da se ovim postupkom mogu uspješno odrediti vrste roda Fusarium.
Keywords
Fusarium culmorum; Fusarium graminearum; mikrovalna ekstrakcija DNA; EF-1α
Hrčak ID:
126185
URI
Publication date:
15.9.2014.
Visits: 2.643 *