Original scientific paper
https://doi.org/10.17113/ftb.52.04.14.3701
Identifikacija različito eksprimiranih gena pomoću metode cDNA-AFLP nakon izlaganja durum pšenice (Triticum durum) vodnom stresu
Marouane Melloul
; Genetic and Biometry Laboratory, Faculty of Sciences, University Ibn Tofail, BP 133, 14000 Kenitra, Morocco
Driss Iraqi
; National Institute of Agronomical Research, Avenue de la Victoire, BP 415, Rabat, Morocco
MyAbdelaziz El Alaoui
; Genetic and Biometry Laboratory, Faculty of Sciences, University Ibn Tofail, BP 133, 14000 Kenitra, Morocco
Gilles Erba
; Labgene Scientifi c Instruments, Athens Building, Business Park, 74160 Archamps, France
Sanaa Alaoui
; Functional Genomic Platform, Technical Unit (UATRS), National Center for Scientifi c and Technical Research (CNRST), Angle Allal Fassi, Avenue des FAR, Hay Riad, BP 8027, 10102 Rabat, Morocco
Mohammed Ibriz
; Genetic and Biometry Laboratory, Faculty of Sciences, University Ibn Tofail, BP 133, 14000 Kenitra, Morocco
Elmostafa Elfahime
; Functional Genomic Platform, Technical Unit (UATRS), National Center for Scientifi c and Technical Research (CNRST), Angle Allal Fassi, Avenue des FAR, Hay Riad, BP 8027, 10102 Rabat, Morocco
Abstract
Suša je najveći abiotički uzročnik smanjenog uroda žitarica. Da bi se poboljšala tolerancija biljaka na sušu neophodno je identificirati različito eksprimirane gene te razumijeti njihovu aktivnost u uvjetima stresa. Transkriptomika je učinkovita metoda analize molekularnih mehanizama u uvjetima abiotičkog stresa. Za identifikaciju smo gena odgovornih za otpornost na sušu pomoću metode cDNA-AFLP ispitali prisutnost mRNA u kontrolnim uzorcima te listovima durum pšenice izloženim vodnom stresu. Uspješno smo sekvencionirali 76 fragmenata gena dobivenih transkripcijom. Većina transkripata, identificiranih pomoću baze podataka BLAST, pripadaju skupinama gena koji imaju ulogu u metabolizmu, prijenosu energije, staničnoj biosintezi, obrani stanica, transdukciji signala, regulaciji transkripcije, razgradnji proteina te prijenosu tvari. Ekspresija je tih gena potvrđena pomoću metode qRT-PCR, koristeći deset odabranih uzoraka gena. Dobiveni bi rezultati mogli pridonijeti razumijevanju staničnih mehanizama koji aktiviraju različite skupine gena u koordiniranom odgovoru na manjak vode. Identifikacijom gena što reagiraju na stres dobiveni su podaci korisni za razvoj tehnika oplemenjivanja, pomoću kojih se može povećati otpornost durum pšenice na sušu.
Keywords
cDNA-AFLP; suša; fragmenti dobiveni transkripcijom; durum pšenica; metoda RT-PCR
Hrčak ID:
130941
URI
Publication date:
15.12.2014.
Visits: 2.355 *