Professional paper

40-Godišnjica institucije Cambridge Crystallographic Data Centre posvećene pohranjivanju podataka o molekularnim i kristalnim strukturama - "Cambridge Structural Database"

B. Kojić-Prodić
K. Molčanov

Abstract

U 2005. obilježila se 40-godišnjica postojanja i rada svjetski poznatog centra Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC), čija je temeljna svrha prikupljanje, provjera i čuvanje kristalografskih podataka koji uz bibliografske podatke sadrže i koordinate atoma i iona koji određuju trodimenzionalnu strukturu molekula u kristalu. Cambridge Structural Database (CSD), jedna od
prvih elektroničkih baza podataka, najveća je i najznačajnija baza kristalografskih podataka na svijetu s gotovo 400.000 pohranjenih struktura. Upotrebu opsežne baze podataka, koja se stalno povećava, nužno prati i razvoj učinkovitih računalnih programa za pretraživanje, analizu i obradu te vizualizaciju. Ključna uloga CSD-a u istraživanjima vezanim uz kristalografiju, kemiju, znanosti o materijalima, fiziku i kemiju čvrstog stanja, znanosti o životu, farmakologiju, posebice u dizajnu lijekova, dokumentirana je u opsežnoj znanstvenoj literaturi. Izuzetna pažnja posvećuje se točnosti pohranjenih podataka i razvoju programske podrške koja omogućuje široku lepezu primjene. Složen i zahtjevan projekt može ostvarivati samo kompetentan tim stručnjaka, a neki zanimljivi podaci ukazuju na strogo znanstven pristup i tradiciju. Namjera ovog prikaza nije samo obilježavanje
jubileja već se želi ukazati na velik broj mogućnosti korištenja baze u istraživanjima i nastavi. Upotreba elektroničkih medija i računalne grafike čini "data mining" ne samo učinkovitim i korisnim, već vizuelno estetskim doživljajem, koji nam pruža arhitektura molekula.
Na Institutu "Ruđer Bošković" već 20 godina uspješno djeluje nekad jugoslavenski, a sada hrvatski nacionalni centar za suradnju sa CCDC-om, koji je i danas odgovoran za akademske korisnike u Hrvatskoj, Sloveniji i Makedoniji omogućavajući im pristup bazi i pratećim računalnim programima.
Upotreba baze u istraživanju prikazana je i vlastitim rezultatima na studiju esterskog kisika kao akceptora protona u nastajanju vodikove veze te topološke analize tubularnih ansambala makrocikličkih politiana.

Keywords

kristalografske baze; CCDC; CSD; kristalna struktura; molekularna struktura; molekularno modeliranje

Hrčak ID:

3772

URI

https://hrcak.srce.hr/3772

Publication date:

12.6.2006.

Article data in other languages: english

Visits: 1.673 *