Skip to the main content

Food Technology and Biotechnology, Vol. 47 No. 4, 2009.

Review article

Programi i baze podataka o peptidima i proteolitičkim enzimima na internetu – kratak osvrt na 2007. i 2008. godinu

Piotr Minkiewicz ; University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Chair of Food Biochemistry, Plac Cieszyński 1, PL-10-726 Olsztyn-Kortowo, Poland
Jerzy Dziuba ; University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Chair of Food Biochemistry, Plac Cieszyński 1, PL-10-726 Olsztyn-Kortowo, Poland
Małgorzata Darewicz ; University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Chair of Food Biochemistry, Plac Cieszyński 1, PL-10-726 Olsztyn-Kortowo, Poland
Anna Iwaniak ; University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Chair of Food Biochemistry, Plac Cieszyński 1, PL-10-726 Olsztyn-Kortowo, Poland
Justyna Michalska ; University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Chair of Food Biochemistry, Plac Cieszyński 1, PL-10-726 Olsztyn-Kortowo, Poland

Full text: english pdf 153 Kb

page 345-355

downloads: 1.273

cite

Abstract

Bioinformatičke metode postale su jedan od najvažnijih alata u području istraživanja peptida. Sve je veći broj dostupnih baza podataka o peptidima, a i „online” programa koji obradom aminokiselinskih sljedova daju informacije o strukturi peptida te njihovim fizikalno-kemijskim i biološkim svojstvima. Mnogi od tih programa dizajnirani su za obradu aminokiselinskih sljedova proteina, ali nemaju ugrađenu restrikciju njihove primjene na oligopeptide koji sadrže manje od 20 aminokiselinskih ostataka. Radovi o takvim programima ne mogu se pronaći u bazama publikacija uporabom ključnih riječi „peptid” ili „peptidi”, u kombinaciji s pojmom „bioinformatika” ili sličnim terminima. Stoga je važno sažeti rezultate objavljenih radova u jednom izvoru. U ovom je radu dan kratak pregled baza podataka o bioaktivnim peptidima i programima za analizu aminokiselinskoga slijeda koji omogućuju: pronalazak peptidnih motiva; određivanje fizikalno-kemijskih svojstava aminokiselinskih ostataka; predviđanje strukture peptida, pojave posttranslacijske glikozilacije i imunogenosti; te programsku podršku za dizajn peptida. Također su prikazani programi i baze podataka o proteolitičkim enzimima. Svi navedeni programi i baze razvijeni su i ažurirani od rujna 2007. do prosinca 2008.

Keywords

peptidi; peptidomika; proteoliza; bioinformatika; baze podataka; internet (world wide web)

Hrčak ID:

43892

URI

https://hrcak.srce.hr/43892

Publication date:

27.11.2009.

Article data in other languages: english

Visits: 2.372 *